Sus principales facultades, funciones y atribuciones son:
- Autorizar y fiscalizar a las empresas sanitarias, servicios de agua potable rural (APR) y sistemas particulares, de agua potable y alcantarillado.
- Autorizar y fiscalizar los sistemas de tratamiento y disposición final de las aguas servidas generadas a nivel industrial, rural y particular.
- Autorizar y fiscalizar los Establecimientos de Atención Comunitaria tales como Establecimientos Educacionales, Hospedaje, Recreacionales, Cementerios y Establecimientos de Uso Público.
- Mantener la vigilancia sobre cuerpos de agua usados con fines recreacionales con contacto directo
